L’hôpital Edouard Herriot dispose de services d’excellence dans quasiment toutes les spécialités médicales et chirurgicales, avec des services phares : la chirurgie d’urgence, la chirurgie orthopédique, les transplantations et l’immunologie, la rhumatologie, l’hépato-gastroentérologie, la médecine et la chirurgie vasculaires, la néphrologie-dialyse, la médecine du vieillissement, le traitement des grands brulés…

L’hôpital Edouard Herriot offre un accueil des urgences 24h sur 24 pour les urgences médicales, chirurgicales et ophtalmologiques et un accueil des urgences dentaires de jour. Il  héberge également le SAMU et le centre de médecine hyperbare.

Il dispose également d’un fort pôle de santé publique avec une permanence d’accès aux soins (PASS), le planning familial, un centre de prise en charge des IVG, des consultations d’accompagnement et de prise en charge des addictions, un centre de dépistage des maladies sexuellement transmissibles…

Enfin, l’hôpital Edouard Herriot abrite des centres de recherche dans le domaine de la rhumatologie (unité INSERM), la banque des tissus et le centre de recherche sur les substituts cutanés.